sblock140661 novel



View on UCSC chr3R:3277173-3277265
chr3R:3277173-3277265 +
TAATGCACATAATAAATGCCAACCATTCATCATGAAATTATAAATAGTATCATTTCAAGATGCATGGTAAGGCTTTATTTTGTTTTGCAATC
...((((((.((((((.(((.(((((.((((.((((((.(((.....))).)))))).)))).)))))..))))))))).)))...)))...-27.00
Sense reads
                                                                                            SizeBlastTotal NormSRR032095 AGO1 IP dcr2 knockdown GSM442736V064 ago2[414], ovary, AGO1IP modENCODE_2746V098 dcr-2[L811fsX] ovary modENCODE_2975V097 CS ovary modENCODE_2976V081 embryo 2-6hr modENCODE_2742V065 dcr-2[L811fsX], ovary, AGO1IP modENCODE_2833V063 CS,ovary,AGO1IP modENCODE_2744SRR014276 Ovary_rep1 NA(fem)_x_Har(male)_F1 SRR014274 Ovary_rep1 LK(fem)_x_Har(male)_F1 SRR014268 Embryo_0-2hrs rep1_HAR_0_2hr_Emb SRR014281 Ovary_rep1 wK(fem)_x_w1118(male)_F1 V019 GM2 cell modENCODE_2004SRR014269 Embryo_0-2hrs rep1_LK_0_2hr_Emb V089 ago2[414] ovary total RNA   modENCODE_2834SRR014272 Embryo_0-2hrs rep1_wK_0_2hr_Emb SRR014270 Embryo_0-2hrs rep1_NA_0_2hr_Emb V082 embryo 14-24hr modENCODE_2743SRR014279 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_wK(male)_F1 V021 ML-DmD21 cell modENCODE_2005SRR014278 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_Har(male)_F1 V067 S2-NP modENCODE_2375GSM379063 Vasa Heterozygote SRR029028 untreated (mock) V033 CMEW1 Cl.8+ cell modENCODE_2721SRR014273 Ovary_rep1_Har_P SRR014280 Ovary_rep1 w1118_P SRR014277 Ovary_rep1 NA_P V075 ML-DmBG1-C1 modENCODE_2007GSM379050 Armi Heterozygote SRR014275 Ovary_rep1 LK_P V090 CS  male total RNA   modENCODE_2751V018 Kc167 cell modENCODE_2606SRR014271 Embryo_0-2hrs rep1_w1118_0_2hr_Emb V076 ML-DmBG3-C2 modENCODE_2719V083 male, one day modENCODE_2008GSM280083 dcr-2-/- ovaries (18-29nt) modENCODE_526V026 1182-4H cell modENCODE_2006SRR029031 loqs-ORF knockdown GSM379062 Squ Mutant GSM379056 Krimp Heterozygote V024 kc167 cell modENCODE_2606V084 female, one day modENCODE_2009GSM379057 Krimp Mutant GSM379058 V028 CMEW1 Cl.8+ cell modENCODE_2721V009 CMEL1 modENCODE_2820SRR032096 AGO2 IP dcr2 knockdown GSM442736 GSM379065 Zuc Heterozygote GSM379061 Squ Heterozygote SRR031701 Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies GSM379054 Flam Heterozygote GSM379052 Aub Heterozygote GSM379066 Zuc Mutant GSM379064 Vasa Mutant V088 r2d2[1] ovary total RNA   modENCODE_2748S21 disk #2 modENCODE_2376GSM280082 WT ovaries (18-29nt) modENCODE_773V001 IR- modENCODE_2971V066 r2d2[1], ovary, AGO1IP modENCODE_2749SRR032093 ago1 knockdown GSM280085 WT testes (18-24nt) modENCODE_772S24 male body #2 modENCODE_2554SRR014282 Ovary_rep1 wK_P GSM280088 S2cell (AGO1IP) modENCODE_2380SRR029633 total small RNAs from hen1 homozygous flies SRR031699 Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies GSM180331 early embryo (2-6) S16 KC -48 #1 modENCODE_738OSS8 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep4 modENCODE_2605 S32 s2+48 #2 modENCODE_2973SRR031693_4 SRR031704 2-O-methylated small RNAs from r2d2 homozygous flies GSM466497 GSM343287 Drosophila Toll 10b mutant embryos GSM379060 SpnE Heterozygote GSM379059 SRR031703 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies S35 KC+48 #2 modENCODE_2974
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGGCT..................221219.0026.0018.0017.0010.0016.007.009.0010.007.005.005.004.003.006.0012.005.004.003.000.002.000.002.000.001.002.000.001.003.002.002.003.003.000.002.002.001.000.000.001.004.000.001.000.002.000.002.000.001.000.000.002.003.002.000.001.000.001.001.001.002.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGGCTT.................231191.0049.0028.0014.0013.004.006.009.005.001.005.002.002.003.000.000.003.003.001.001.003.003.002.000.002.001.002.001.001.002.000.000.000.000.001.001.001.001.003.001.000.001.002.001.001.002.001.002.002.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGGCTTT................241102.004.0010.003.009.008.007.002.003.006.000.004.001.002.005.000.001.003.001.000.002.002.003.000.002.002.000.000.000.000.003.000.000.000.002.002.001.001.000.000.000.002.000.002.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.002.000.002.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGGC...................21158.000.003.004.002.001.003.000.003.002.003.002.005.002.000.000.000.000.001.006.000.001.000.005.000.000.003.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.002.000.001.001.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.000.001.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.00
........................................................AAGATGCATGGTAAGGCTTTATT.............23117.002.000.001.001.001.000.000.000.002.000.001.000.000.000.000.000.001.002.000.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................................TTCAAGATGCATGGTAAGGCTT.................22117.005.002.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.005.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGG....................20114.000.000.000.000.001.001.004.000.000.002.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGGCTTTA...............25110.000.000.003.000.002.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................................................AAGATGCATGGTAAGGCTTTAT..............22110.000.000.002.001.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.000.001.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............AAATGCCAACCATTCATCATGA.........................................................2216.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAG.....................1915.000.002.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.00
.....................................................TTCAAGATGCATGGTAAGGCTTTAT..............2515.001.000.000.000.001.001.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................TTTCAAGATGCATGGTAAGGCTTTAT..............2614.000.000.001.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................................TTCAAGATGCATGGTAAGGCT..................2114.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................GATGCATGGTAAGGCTTTATT.............2112.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...................................................ATTTCAAGATGCATGGTAAGGCT..................2312.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................................................TCAAGATGCATGGTAAGGCTTT................2212.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................................................TCAAGATGCATGGTAAGGCT..................2012.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................................................AAGATGCATGGTAAGGCTT.................1911.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................TGCCAACCATTCATCATGAAATT.....................................................2311.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................................................AAGATGCATGGTAAGGCTTTATTT............2411.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................................TTCAAGATGCATGGTAAGGCTTT................2311.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................................................ATCATTTCAAGATGCATGGTAAGGCT..................2611.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............AAATGCCAACCATTCATCATGAA........................................................2311.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00

Antisense reads
                                                                                            SizeBlastTotal NormSRR032095 AGO1 IP dcr2 knockdown _GSM442736V064 ago2[414], ovary, AGO1IP_modENCODE_2746V098 dcr-2[L811fsX] ovary_modENCODE_2975V097 CS ovary_modENCODE_2976V081 embryo 2-6hr_modENCODE_2742V065 dcr-2[L811fsX], ovary, AGO1IP_modENCODE_2833V063 CS,ovary,AGO1IP_modENCODE_2744SRR014276 Ovary_rep1 NA(fem)_x_Har(male)_F1 _SRR014274 Ovary_rep1 LK(fem)_x_Har(male)_F1 _SRR014268 Embryo_0-2hrs rep1_HAR_0_2hr_Emb _SRR014281 Ovary_rep1 wK(fem)_x_w1118(male)_F1 _V019 GM2 cell_modENCODE_2004SRR014269 Embryo_0-2hrs rep1_LK_0_2hr_Emb _V089 ago2[414] ovary total RNA  _modENCODE_2834SRR014272 Embryo_0-2hrs rep1_wK_0_2hr_Emb _SRR014270 Embryo_0-2hrs rep1_NA_0_2hr_Emb _V082 embryo 14-24hr_modENCODE_2743SRR014279 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_wK(male)_F1 _V021 ML-DmD21 cell_modENCODE_2005SRR014278 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_Har(male)_F1 _V067 S2-NP_modENCODE_2375GSM379063 Vasa Heterozygote _SRR029028 untreated (mock) _V033 CMEW1 Cl.8+ cell_modENCODE_2721SRR014273 Ovary_rep1_Har_P _SRR014280 Ovary_rep1 w1118_P _SRR014277 Ovary_rep1 NA_P _V075 ML-DmBG1-C1_modENCODE_2007GSM379050 Armi Heterozygote _SRR014275 Ovary_rep1 LK_P _V090 CS  male total RNA  _modENCODE_2751V018 Kc167 cell_modENCODE_2606SRR014271 Embryo_0-2hrs rep1_w1118_0_2hr_Emb _V076 ML-DmBG3-C2_modENCODE_2719V083 male, one day_modENCODE_2008GSM280083 dcr-2-/- ovaries (18-29nt) _modENCODE_526V026 1182-4H cell_modENCODE_2006SRR029031 loqs-ORF knockdown _GSM379062 Squ Mutant _GSM379056 Krimp Heterozygote _V024 kc167 cell_modENCODE_2606V084 female, one day_modENCODE_2009GSM379057 Krimp Mutant _GSM379058 _V028 CMEW1 Cl.8+ cell_modENCODE_2721V009 CMEL1_modENCODE_2820SRR032096 AGO2 IP dcr2 knockdown_GSM442736 GSM379065 Zuc Heterozygote _GSM379061 Squ Heterozygote _SRR031701 Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies _GSM379054 Flam Heterozygote _GSM379052 Aub Heterozygote _GSM379066 Zuc Mutant _GSM379064 Vasa Mutant _V088 r2d2[1] ovary total RNA  _modENCODE_2748S21 disk #2_modENCODE_2376GSM280082 WT ovaries (18-29nt) _modENCODE_773V001 IR-_modENCODE_2971V066 r2d2[1], ovary, AGO1IP_modENCODE_2749SRR032093 ago1 knockdown _GSM280085 WT testes (18-24nt) _modENCODE_772S24 male body #2_modENCODE_2554SRR014282 Ovary_rep1 wK_P _GSM280088 S2cell (AGO1IP) _modENCODE_2380SRR029633 total small RNAs from hen1 homozygous flies _SRR031699 Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies _GSM180331 early embryo (2-6) _S16 KC -48 #1_modENCODE_738OSS8 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep4 _modENCODE_2605 S32 s2+48 #2_modENCODE_2973SRR031693_4 _SRR031704 2-O-methylated small RNAs from r2d2 homozygous flies _GSM466497 GSM343287 Drosophila Toll 10b mutant embryos _GSM379060 SpnE Heterozygote _GSM379059 _SRR031703 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies _S35 KC+48 #2_modENCODE_2974
............TAAATGCCAACCATTCATCAT...........................................................2112.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........AATAAATGCCAACCATTCATCA............................................................2212.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
............TAAATGCCAACCATTCATCA............................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..................CCAACCATTCATCATGAA........................................................1811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00