sblock175017 novel



View on UCSC chrX:2438772-2438941
chrX:2438772-2438941 -
CACCGATTTGCTTCCCCTTTTTCCGTGCGCGGAGAAAAAAATCCCCAGAAACATAATATCAGGATGCTCTCTATCTCTGTCTCTGTCTAACGCTTAATTGTTGCTCAATTGCGAATTAATGTCTGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCAGTGCCATAGCCGTAACCACAACCT
.......((((..............((((((((((((((((.(((((((....((((..(((((((.....)))).)))...........(((..(((((.....)))))))).))))...))))))).))))))))))))))))..((....)).)))).........-48.50
Sense reads
                                                                                                                                                                         SizeBlastTotal NormS32 s2+48 #2 modENCODE_2973S33 KC-48 #2 modENCODE_2374S31 s2+48 #1 modENCODE_2973S35 KC+48 #2 modENCODE_2974S29 male head #1 modENCODE_751S16 KC -48 #1 modENCODE_738S34 KC+48 #1 modENCODE_2974OSS7 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep3 modENCODE_2605 OSS6 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep2 modENCODE_2605 S24 male body #2 modENCODE_2554S9 0-1h #3 (7) modENCODE_755OSS8 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep4 modENCODE_2605 S19 2-4day pupae #1 modENCODE_757S28 0-2d pupae modENCODE_2556S27 0-1d Pupae (w) modENCODE_2543OSS2 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep1 modENCODE_2605 S23 female body #2 modENCODE_2555S8 S2-48,+48, KC-48, +48 mix modENCODE_741S17 3rd inster #1 modENCODE_749SRR031704 2-O-methylated small RNAs from r2d2 homozygous flies GSM466497 SRR031702 2-O-methylated small RNAs from r2d2 heterozygous flies GSM466495 S22 female head #1 modENCODE_750SRR031698 2-O-methylated small RNAs from dcr-2 heterozygous flies GSM466491 S5 imaginal disc modENCODE_742GSM379057 Krimp Mutant S7 12-24hr embryo modENCODE_2741SRR031693_4 S30 s2-48 #2 modENCODE_2725S20 2-4day pupae#2 modENCODE_758V076 ML-DmBG3-C2 modENCODE_2719SRR029633 total small RNAs from hen1 homozygous flies V009 CMEL1 modENCODE_2820GSM379065 Zuc Heterozygote S1 male head modENCODE_747GSM379051 Armi Mutant SRR014273 Ovary_rep1_Har_P SRR001347 ago2 untreated GSM379050 Armi Heterozygote SRR010952 Ago3 trans-heterozygotes, oxidized SRX002237 S26 1st instar #2 modENCODE_2546GSM379061 Squ Heterozygote SRR010958 Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotes SRX002243 GSM379053 Aub Mutant V018 Kc167 cell modENCODE_2606SRR014278 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_Har(male)_F1 SRR031701 Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies SRR031699 Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies V020 S2R+ cell modENCODE_2608GSM379063 Vasa Heterozygote S25 1st instar #1 modENCODE_762S2 female head modENCODE_737SRR031703 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies S18 3rd inster #2 modENCODE_748GSM180335 imaginal discs SRR014276 Ovary_rep1 NA(fem)_x_Har(male)_F1 S4 female body modENCODE_743V088 r2d2[1] ovary total RNA   modENCODE_2748S15 S2 -48 #1 modENCODE_746GSM379066 Zuc Mutant S21 disk #2 modENCODE_2376
...........................................................................................................................TGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCA........................221157.0024.0016.0011.0013.0012.009.009.006.001.003.009.002.004.002.004.002.002.003.002.003.001.001.002.001.000.002.000.001.002.000.000.000.000.001.000.001.001.000.000.001.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.001.000.001.001.000.001.000.001.000.000.00
.............................................................................................................................GGGCTTTTTTTCTCCGTGCAG.......................21133.005.004.009.005.000.001.000.001.000.002.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.001.000.002.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................................................................................TGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCAG.......................23130.000.005.002.002.004.001.002.002.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.001.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.00
.............................................................................................................................GGGCTTTTTTTCTCCGTGCAGT......................22120.003.004.000.000.000.001.001.000.000.000.000.001.001.004.001.001.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................CGCGGAGAAAAAAATCCCCAGA........................................................................................................................22117.000.001.003.003.000.001.001.001.002.000.000.000.001.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................................................................................TGGGGCTTTTTTTCTCCGTGC.........................21111.003.001.000.000.000.001.000.000.001.000.000.001.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.00
............................GCGGAGAAAAAAATCCCCAGA........................................................................................................................2115.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................................................................................................................GGCTTTTTTTCTCCGTGCAG.......................2014.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.00
.........................................................................................................................TCTGGGGCTTTTTTTCTCCGTG..........................2213.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................................................................................................................GGCTTTTTTTCTCCGTGCAGT......................2113.000.000.000.001.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................................................................................................................GGGCTTTTTTTCTCCGTGCA........................2013.000.000.000.000.000.001.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................TTCCGTGCGCGGAGAAAAAAATCCCCA..........................................................................................................................2712.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................................................................................................................GGGCTTTTTTTCTCCGTGC.........................1912.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.........................TGCGCGGAGAAAAAAATCCCC...........................................................................................................................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.......................................................................................TAACGCTTAATTGTTGCTCAATTGCGAA......................................................2811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................GCGCGGAGAAAAAAATCCCC...........................................................................................................................2011.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................................................................................CTGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCAG.......................2411.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.......................................................................................TAACGCTTAATTGTTGCTCAATTGC.........................................................2511.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................CGCGGAGAAAAAAATCCCCAG.........................................................................................................................2111.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
............................GCGGAGAAAAAAATCCCCAG.........................................................................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...............................................................................................................................GCTTTTTTTCTCCGTGCAG.......................1911.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.........................TGCGCGGAGAAAAAAATCCC............................................................................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................................................................................................................................................ATAGCCGTAACCACAACC.1811.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...................................................................................................................................................GCCATAGCCGTAACCACA....1811.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................................................................................................................GTCTGGGGCTTTTTTTCTCCGT...........................2211.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................................ATCCCCAGAAACATAATATCAGGATGC......................................................................................................2711.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.......................CGTGCGCGGAGAAAAAAATCCCC...........................................................................................................................2311.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................................................................................................................CCATAGCCGTAACCACAA...1811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................................................................................TGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCAGT......................2411.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................................................................................CTGGGGCTTTTTTTCTCCGTGC.........................2211.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................................................................................CTCTGTCTAACGCTTAATTGTTGCT................................................................2511.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.00
.............................CGGAGAAAAAAATCCCCAGA........................................................................................................................2011.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00

Antisense reads
                                                                                                                                                                         SizeBlastTotal NormS32 s2+48 #2_modENCODE_2973S33 KC-48 #2_modENCODE_2374S31 s2+48 #1_modENCODE_2973S35 KC+48 #2_modENCODE_2974S29 male head #1_modENCODE_751S16 KC -48 #1_modENCODE_738S34 KC+48 #1_modENCODE_2974OSS7 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep3 _modENCODE_2605 OSS6 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep2 _modENCODE_2605 S24 male body #2_modENCODE_2554S9 0-1h #3 (7)_modENCODE_755OSS8 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep4 _modENCODE_2605 S19 2-4day pupae #1_modENCODE_757S28 0-2d pupae_modENCODE_2556S27 0-1d Pupae (w)_modENCODE_2543OSS2 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep1 _modENCODE_2605 S23 female body #2_modENCODE_2555S8 S2-48,+48, KC-48, +48 mix_modENCODE_741S17 3rd inster #1_modENCODE_749SRR031704 2-O-methylated small RNAs from r2d2 homozygous flies _GSM466497 SRR031702 2-O-methylated small RNAs from r2d2 heterozygous flies _GSM466495 S22 female head #1_modENCODE_750SRR031698 2-O-methylated small RNAs from dcr-2 heterozygous flies _GSM466491 S5 imaginal disc_modENCODE_742GSM379057 Krimp Mutant _S7 12-24hr embryo_modENCODE_2741SRR031693_4 _S30 s2-48 #2_modENCODE_2725S20 2-4day pupae#2_modENCODE_758V076 ML-DmBG3-C2_modENCODE_2719SRR029633 total small RNAs from hen1 homozygous flies _V009 CMEL1_modENCODE_2820GSM379065 Zuc Heterozygote _S1 male head_modENCODE_747GSM379051 Armi Mutant _SRR014273 Ovary_rep1_Har_P _SRR001347 ago2 untreated _GSM379050 Armi Heterozygote _SRR010952 Ago3 trans-heterozygotes, oxidized _SRX002237 S26 1st instar #2_modENCODE_2546GSM379061 Squ Heterozygote _SRR010958 Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotes _SRX002243 GSM379053 Aub Mutant _V018 Kc167 cell_modENCODE_2606SRR014278 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_Har(male)_F1 _SRR031701 Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies _SRR031699 Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies _V020 S2R+ cell_modENCODE_2608GSM379063 Vasa Heterozygote _S25 1st instar #1_modENCODE_762S2 female head_modENCODE_737SRR031703 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies _S18 3rd inster #2_modENCODE_748GSM180335 imaginal discs _SRR014276 Ovary_rep1 NA(fem)_x_Har(male)_F1 _S4 female body_modENCODE_743V088 r2d2[1] ovary total RNA  _modENCODE_2748S15 S2 -48 #1_modENCODE_746GSM379066 Zuc Mutant _S21 disk #2_modENCODE_2376
...................................................CATAATATCAGGATGCTCTC..................................................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.........................................................................................................................TCTGGGGCTTTTTTTCTCCGT...........................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................................................................TCTGTCTAACGCTTAATTGTT...................................................................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00