sblock179020 novel



View on UCSC chrX:6979769-6979886
chrX:6979769-6979886 -
AGGGGGCGGCAACATGTGCCACCTGCCGCCGATGGCCAGCAACAACTCGCTGAATAATCTCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGTGGTAGTGATGATCTCATGAACGATCCTCGGGC
.(((((((....((((.(.((((((((((((.((.(((((.((((..(((.((......)).)))..)))).))))).)).))))))))).).))..).))))..)).)))))....-53.30
Sense reads
                                                                                                                     SizeBlastTotal NormV081 embryo 2-6hr modENCODE_2742V082 embryo 14-24hr modENCODE_2743V097 CS ovary modENCODE_2976SRR010958 Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotes SRX002243 SRR014278 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_Har(male)_F1 SRR014270 Embryo_0-2hrs rep1_NA_0_2hr_Emb SRR031702 2-O-methylated small RNAs from r2d2 heterozygous flies GSM466495 SRR014268 Embryo_0-2hrs rep1_HAR_0_2hr_Emb SRR031696_2152 Ago1-associated small RNAs from Oregon R . SRR031698 2-O-methylated small RNAs from dcr-2 heterozygous flies GSM466491 SRR010955 Aub IP in Ago3 heterozygotes SRX002240 SRR031701 Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies SRR029030 dcr-2 knockdown SRR014273 Ovary_rep1_Har_P SRR014272 Embryo_0-2hrs rep1_wK_0_2hr_Emb S33 KC-48 #2 modENCODE_2374V067 S2-NP modENCODE_2375SRR014281 Ovary_rep1 wK(fem)_x_w1118(male)_F1 V001 IR- modENCODE_2971SRR029633 total small RNAs from hen1 homozygous flies SRR010954 Aub trans-heterozygotes, oxidized SRX002239 SRR014277 Ovary_rep1 NA_P V002 IR+ modENCODE_2972GSM379052 Aub Heterozygote V098 dcr-2[L811fsX] ovary modENCODE_2975V084 female, one day modENCODE_2009OSS2 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep1 modENCODE_2605 GSM379051 Armi Mutant V089 ago2[414] ovary total RNA   modENCODE_2834V011 Sg4 modENCODE_2003SRR010952 Ago3 trans-heterozygotes, oxidized SRX002237 V076 ML-DmBG3-C2 modENCODE_2719SRR023197 RNA Library from S2 control cells SRR031700 2-O-methylated small RNAs from dcr-2 homozygous flies GSM466493 S22 female head #1 modENCODE_750SRR010956 Piwi IP in Ago3 heterozygotes SRX002241 SRR023399 RNA bound by P19 protein SRX008034 S24 male body #2 modENCODE_2554V028 CMEW1 Cl.8+ cell modENCODE_2721SRR014282 Ovary_rep1 wK_P S27 0-1d Pupae (w) modENCODE_2543V083 male, one day modENCODE_2008SRR001338 IR non-beta-eliminated SRR031699 Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies SRR023402 total RNA extracted from NLS-P19 cells OSS7 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep3 modENCODE_2605 SRR010960 wt, oxidized SRX002245 GSM280083 dcr-2-/- ovaries (18-29nt) modENCODE_526V024 kc167 cell modENCODE_2606V033 CMEW1 Cl.8+ cell modENCODE_2721V009 CMEL1 modENCODE_2820GSM379054 Flam Heterozygote SRR010951 Ago3 heterozygotes, oxidized SRX002202 S34 KC+48 #1 modENCODE_2974SRR014276 Ovary_rep1 NA(fem)_x_Har(male)_F1 V019 GM2 cell modENCODE_2004V088 r2d2[1] ovary total RNA   modENCODE_2748S32 s2+48 #2 modENCODE_2973GSM379065 Zuc Heterozygote S21 disk #2 modENCODE_2376
..............................................................GCGGATTGTCGCTGGGCAGCGG.................................22110.002.001.000.000.000.002.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...............................................................CGGATTGTCGCTGGGCAGCGGT................................22110.001.000.001.000.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..................................................................ATTGTCGCTGGGCAGCGGTGGT.............................2218.001.001.000.000.001.000.001.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................CGATGGCCAGCAACAACTCGCT..................................................................2217.000.000.000.000.000.000.001.000.003.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..................................................................ATTGTCGCTGGGCAGCGGTGG..............................2117.001.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................TCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGT................................2616.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.00
...............................................................CGGATTGTCGCTGGGCAGCGG.................................2114.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.003.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................................................................GGATTGTCGCTGGGCAGCGGT................................2113.000.001.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................................................GATTGTCGCTGGGCAGCGGTGG..............................2213.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................................................TGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGG.................................2313.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................CGATGGCCAGCAACAACTCG....................................................................2012.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................................TGTCGCTGGGCAGCGGTGGTAGTGATG......................2712.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................................ATAATCTCTGCGGATTGTC.............................................1912.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................................TGTCGCTGGGCAGCGGTG...............................1812.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................CTCTGCGGATTGTCGCTGG........................................1912.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...................................................................TTGTCGCTGGGCAGCGGTG...............................1912.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.000.000.000.000.00
............................................................CTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGT................................2512.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.........................................................TCTCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGG.................................2712.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................................................................CGGTGGTAGTGATGATCTCATGAA............2412.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
............................................ACTCGCTGAATAATCTCTGCGGATTGT..............................................2712.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................CGATGGCCAGCAACAACTCGC...................................................................2112.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................................................GATTGTCGCTGGGCAGCGGTG...............................2112.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...............................................................CGGATTGTCGCTGGGCAGC...................................1911.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................................................TGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGT................................2411.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................................................GCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGTGGTA............................2711.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..................................................TGAATAATCTCTGCGGATTGTCGCT..........................................2511.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.......................................................AATCTCTGCGGATTGTCGC...........................................1911.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................ACCTGCCGCCGATGGCCA...............................................................................1811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.00
.............................................................TGCGGATTGTCGCTGGGCA.....................................1911.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................CTCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCG..................................2511.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................................................TAATCTCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGC...................................2811.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................................................TGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGTG...............................2511.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................CTCTGCGGATTGTCGCTGGG.......................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................................................GCTGAATAATCTCTGCGGATTGTC.............................................2411.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................GATGGCCAGCAACAACTCGCTG.................................................................2211.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................................GGGCAGCGGTGGTAGTGATGA.....................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.00
..............................GATGGCCAGCAACAACTCGC...................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................................ATAATCTCTGCGGATTGTCGCT..........................................2211.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................TCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGC...................................2311.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.............................................CTCGCTGAATAATCTCTGCGGATTG...............................................2511.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................................................GCTGAATAATCTCTGCGGATTGTCGC...........................................2611.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.00
..................................................................ATTGTCGCTGGGCAGCGGTG...............................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...............................................CGCTGAATAATCTCTGCGGA..................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................GCCGCCGATGGCCAGCAA...........................................................................1811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.00
.........................................................TCTCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGC...................................2511.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................................................GCGGATTGTCGCTGGGCAGCG..................................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................TCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGG.................................2511.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................................AATAATCTCTGCGGATTGTCGCTG.........................................2411.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................GATGGCCAGCAACAACTCGCT..................................................................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.......................TGCCGCCGATGGCCAGCAACAAC.......................................................................2311.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
................................TGGCCAGCAACAACTCGCTGAATAATC..........................................................2711.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................AGCAACAACTCGCTGAATAATCTCTGCGGA..................................................3011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...............................ATGGCCAGCAACAACTCGCTG.................................................................2111.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00