sblock48653 candidate



View on UCSC chr2R:15518559-15518698
chr2R:15518559-15518698 -
CATACGCATCGAGTTGTTGTTTGTTTGTTGTTTGTGTCTGTCCTCGCGTTTTGTTTGTGTACTGACAAAATAACAACAAAATAAAACCCGAAAGACTGCGAATAAGCATAAATAATAAACAACGAGACAAGTGCAAAAA
.....((((....(((((..((((((((((((((((..(((..(((((((((((((.(((............)))...))))))))).(....)...)))))))..))))))))))))))))...))))))))).....-37.40
Sense reads
                                                                                                                                           SizeBlastTotal NormV081 embryo 2-6hr modENCODE_2742V098 dcr-2[L811fsX] ovary modENCODE_2975V097 CS ovary modENCODE_2976V082 embryo 14-24hr modENCODE_2743SRR029633 total small RNAs from hen1 homozygous flies SRR014280 Ovary_rep1 w1118_P SRR031696_2152 Ago1-associated small RNAs from Oregon R . SRR014271 Embryo_0-2hrs rep1_w1118_0_2hr_Emb SRR031701 Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies S12 6-10h #1 (10) modENCODE_754SRR031697 Total small RNAs from dcr-2 heterozygous flies SRR031692 Total small RNAs from Oregon R V084 female, one day modENCODE_2009SRR001664 homozygous dcr-2_untreated V076 ML-DmBG3-C2 modENCODE_2719V065 dcr-2[L811fsX], ovary, AGO1IP modENCODE_2833S33 KC-48 #2 modENCODE_2374SRR014281 Ovary_rep1 wK(fem)_x_w1118(male)_F1 V001 IR- modENCODE_2971V083 male, one day modENCODE_2008S29 male head #1 modENCODE_751S24 male body #2 modENCODE_2554V002 IR+ modENCODE_2972S10 2-6h #1 (8) modENCODE_740SRR031703 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies GSM379054 Flam Heterozygote V089 ago2[414] ovary total RNA   modENCODE_2834V090 CS  male total RNA   modENCODE_2751SRR014278 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_Har(male)_F1 SRR031699 Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies OSS7 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep3 modENCODE_2605 GSM379065 Zuc Heterozygote GSM379062 Squ Mutant GSM379056 Krimp Heterozygote GSM343287 Drosophila Toll 10b mutant embryos SRR001349 heterozygous dcr-2_untreated S22 female head #1 modENCODE_750SRR010955 Aub IP in Ago3 heterozygotes SRX002240 OSS2 Drosophila OSS cell small RNA libraries, rep1 modENCODE_2605 GSM379057 Krimp Mutant V064 ago2[414], ovary, AGO1IP modENCODE_2746SRR014273 Ovary_rep1_Har_P S26 1st instar #2 modENCODE_2546V018 Kc167 cell modENCODE_2606SRR014282 Ovary_rep1 wK_P SRR014279 Ovary_rep1 w1118(fem)_x_wK(male)_F1 S3 male body modENCODE_739GSM180332 mid embryo (6-10) GSM180331 early embryo (2-6) S5 imaginal disc modENCODE_742SRR001341 WT_males non-beta-eliminated V063 CS,ovary,AGO1IP modENCODE_2744SRR001339 WT_females non-beta-eliminated S7 12-24hr embryo modENCODE_2741GSM379051 Armi Mutant V075 ML-DmBG1-C1 modENCODE_2007S13 6-10h #2 (11) modENCODE_753S23 female body #2 modENCODE_2555GSM379060 SpnE Heterozygote SRR001338 IR non-beta-eliminated S28 0-2d pupae modENCODE_2556GSM379063 Vasa Heterozygote SRR001345 ago2 non-beta-eliminated V020 S2R+ cell modENCODE_2608SRR014269 Embryo_0-2hrs rep1_LK_0_2hr_Emb V066 r2d2[1], ovary, AGO1IP modENCODE_2749GSM379059 GSM379052 Aub Heterozygote SRR014276 Ovary_rep1 NA(fem)_x_Har(male)_F1 GSM379066 Zuc Mutant
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTGTCCTC..............................................................................................241180.0056.0023.0014.0025.005.007.001.008.000.002.001.000.003.000.002.002.000.000.001.002.000.000.002.003.000.001.001.002.001.000.000.001.002.002.000.000.001.000.000.000.000.001.000.001.001.000.000.001.000.001.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.001.001.001.000.001.001.000.000.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTGTCCT...............................................................................................23152.009.008.009.008.000.000.001.000.000.006.000.000.000.000.001.001.000.002.001.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTGTC.................................................................................................21131.001.007.004.002.001.002.001.000.002.000.000.000.000.000.001.002.000.002.001.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTGTCC................................................................................................22129.001.0011.007.002.000.002.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.001.002.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................GTACTGACAAAATAACAACA.............................................................20125.001.000.000.000.003.000.005.000.005.000.001.001.000.001.000.000.000.000.000.000.003.000.000.000.001.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTGT..................................................................................................20118.000.001.001.001.001.000.002.000.000.000.000.000.000.002.001.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.00
..........................................................GTACTGACAAAATAACAACAAA...........................................................22113.000.000.000.000.003.000.001.000.000.000.001.002.000.002.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................................GTACTGACAAAATAACAACAA............................................................2118.000.000.000.000.001.000.000.000.001.000.002.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..TACGCATCGAGTTGTTGTTTGT...................................................................................................................2214.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.004.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCT....................................................................................................1813.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
....................................TCTGTCCTCGCGTTTTGTTTGTGT...............................................................................2412.000.001.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................GTTTGTTGTTTGTGTCTGTCCTC..............................................................................................2312.001.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................................................................TAAAACCCGAAAGACTGCGAATAAGCAT..............................2812.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.002.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................GTTTGTTGTTTGTGTCTGTCCT...............................................................................................2211.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...................TTTGTTTGTTGTTTGTGTCT....................................................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................................................................................ACCCGAAAGACTGCGAATAAGCATAAA...........................2711.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................TTGTTTGTGTCTGTCCTCGCG...........................................................................................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
......................................................................................................TAAGCATAAATAATAAAC...................1811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................GTGTCTGTCCTCGCGTTTTGT.....................................................................................2111.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..............................................................................AAATAAAACCCGAAAGACTGC........................................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.00
.............................GTTTGTGTCTGTCCTCGCGT..........................................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
............................................................................CAAAATAAAACCCGAAAGACTGCG.......................................2411.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTG...................................................................................................1911.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...........................................................TACTGACAAAATAACAACAA............................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...................................GTCTGTCCTCGCGTTTTGTT....................................................................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
........................................................................................CGAAAGACTGCGAATAAGCAT..............................2111.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
..........................................CTCGCGTTTTGTTTGTGTACTGA..........................................................................2311.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.................................................................................TAAAACCCGAAAGACTGCGA......................................2011.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.00
.......................................GTCCTCGCGTTTTGTTTGTGTACTGACA........................................................................2811.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
...................................................................AAATAACAACAAAATAAAACCCGAAAGAC...........................................2911.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00
.....................TGTTTGTTGTTTGTGTCTGTCCTCG.............................................................................................2511.001.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00