Coverage plot

ruby-cand-201




chrX 15264758-15264959 -

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Plus strand
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GSM154621 piRNAs associated with Ago3 from Drosophila melanogaster ovaries_SRR001344 dcr-2_beta-eliminated_GSM278692 SRR001339 WT_females_non-beta-eliminated_SRR010957 Aub IP in Ago3 trans-heterozygotes_SRX002242 SRR014270 Embryo_0-2hrs_rep1_NA_0_2hr_Emb_SRR014268 Embryo_0-2hrs_rep1_HAR_0_2hr_Emb_GSM379062 Squ Mutant_SRR010952 "Ago3 trans-heterozygotes, oxidized"_SRX002237 SRR014271 Embryo_0-2hrs_rep1_w1118_0_2hr_Emb_SRR031696_2152 _GSM180336 "pupae: 0-1 day, 0-2 day, 2-4 day"_SRR001664 homozygous_dcr-2_untreated_SRR010958 Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotes_SRX002243 SRR001337 WT_females_beta-eliminated_GSM278573 SRR023197 RNA Library from S2 control cells_SRR032092 mock oxidized_SRR029033 lacZ knockdown_SRR001349 heterozygous_dcr-2_untreated_SRR010956 Piwi IP in Ago3 heterozygotes_SRX002241 SRR023399 RNA bound by P19 protein_SRX008034 SRR010955 Aub IP in Ago3 heterozygotes_SRX002240 GSM379060 SpnE Heterozygote_GSM424740 S2 pKF63 stably transfected_SRR010954 "Aub trans-heterozygotes, oxidized"_SRX002239 SRR023400 total RNA extracted from P19 cells_SRR001338 IR_non-beta-eliminated_GSM239052 "S2 cells, non beta-eliminated"_SRR001345 ago2_non-beta-eliminated_SRR023407 RNA bound by NLS-P19 protein_SRX008041 GSM424739 S2 parental_GSM239041 "fly heads, non beta-eliminated"_GSM180337 tissue culture cells (S2 only)_SRR010960 "wt, oxidized"_SRX002245 SRR023402 total RNA extracted from NLS-P19 cells_SRR001340 IR_beta-eliminated_GSM278575 SRR032093 ago1 knockdown_GSM180329 "adult bodies (female bodies, male bodies)"_SRR001346 ago2_beta-eliminated_GSM278648 SRR014275 Ovary_rep1_LK_P_SRR001343 dcr-2_non-beta-eliminated_GSM154622 piRNAs associated with Aubergine from Drosophila melanogaster ovaries_
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Minus strand
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GSM154621 piRNAs associated with Ago3 from Drosophila melanogaster ovaries_SRR001344 dcr-2_beta-eliminated_GSM278692 SRR001339 WT_females_non-beta-eliminated_SRR010957 Aub IP in Ago3 trans-heterozygotes_SRX002242 SRR014270 Embryo_0-2hrs_rep1_NA_0_2hr_Emb_SRR014268 Embryo_0-2hrs_rep1_HAR_0_2hr_Emb_GSM379062 Squ Mutant_SRR010952 "Ago3 trans-heterozygotes, oxidized"_SRX002237 SRR014271 Embryo_0-2hrs_rep1_w1118_0_2hr_Emb_SRR031696_2152 _GSM180336 "pupae: 0-1 day, 0-2 day, 2-4 day"_SRR001664 homozygous_dcr-2_untreated_SRR010958 Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotes_SRX002243 SRR001337 WT_females_beta-eliminated_GSM278573 SRR023197 RNA Library from S2 control cells_SRR032092 mock oxidized_SRR029033 lacZ knockdown_SRR001349 heterozygous_dcr-2_untreated_SRR010956 Piwi IP in Ago3 heterozygotes_SRX002241 SRR023399 RNA bound by P19 protein_SRX008034 SRR010955 Aub IP in Ago3 heterozygotes_SRX002240 GSM379060 SpnE Heterozygote_GSM424740 S2 pKF63 stably transfected_SRR010954 "Aub trans-heterozygotes, oxidized"_SRX002239 SRR023400 total RNA extracted from P19 cells_SRR001338 IR_non-beta-eliminated_GSM239052 "S2 cells, non beta-eliminated"_SRR001345 ago2_non-beta-eliminated_SRR023407 RNA bound by NLS-P19 protein_SRX008041 GSM424739 S2 parental_GSM239041 "fly heads, non beta-eliminated"_GSM180337 tissue culture cells (S2 only)_SRR010960 "wt, oxidized"_SRX002245 SRR023402 total RNA extracted from NLS-P19 cells_SRR001340 IR_beta-eliminated_GSM278575 SRR032093 ago1 knockdown_GSM180329 "adult bodies (female bodies, male bodies)"_SRR001346 ago2_beta-eliminated_GSM278648 SRR014275 Ovary_rep1_LK_P_SRR001343 dcr-2_non-beta-eliminated_GSM154622 piRNAs associated with Aubergine from Drosophila melanogaster ovaries_
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