| seed | --------------------------------------------------------GAGAUCA----------------------------- | 0 | miR-80/81/82 |
| | | |
| cel-miR-1834 | -------------------------------------------------------AGAGATCAA-------CCATTGAGATCCAA------- | 23 |
| celegans | ----TGAC------------TCGGTGTGTGATCTCTTACCGTTTTA---TGGATAAGAGATCAA-------CCATTGAGATCCAA------- | |
| cbriggsae | --ATTGGC------------TTGTTATCTGGTCTCATAACTACTTTTCCTGGTTATGAGATCAT-------TTAATGAG-CCCAA------- | |
| cbrenneri | ---TTGAC------------CTTATGGTTGATCTCCTACCGACTAG---CGGATAAGAGATCAC---------CATGGGGTACAA------- | |
| ppacificus | GATCTGACCGGACTCTCTCACTTTCGCATGCTCTCTCGCTGTCTCTGA-CCGACGAGAGATCATGGCGAAGTGAGAGAGTCTCGAGCGAGTT | |
| | ** * ** **** * * ******* * * * * | |
| celegans | ...( ((((((..((((((((((((((...) ))).)))))))))). .)))))))...... | 1.000 -25.90 |
| cbriggsae | ...((( (..(((..((((((((((((((.......)))))))))))))). .)))..)) ))... | 1.000 -29.80 |
| cbrenneri | .(((( (((((((.(((((((.(((((..... ))).)).)))))))) )))))))).)). | 1.000 -27.70 |
| ppacificus | ((..((..(((((((((((((.((((((((.(((((((..(((...)) )...))))))).)))).))))))))))))))).))..))..)) | 1.000 -44.70 |