| seed | ------------------------------------------------------------------------------------UCGUUGU----------------------------------------------------------- | 313 | novel |
| seed | ----------------------------------------------------------------------------------------UGUUGAU------------------------------------------------------- | 3 | novel |
| | | | CE1 |
| | -----------------------------------------------------------------------------------TTCGTTGTTGATGAA----------GCCTTG------------------------------------ | 21 | 309 |
| | ---------------------------------------------------------------------------------------TTGTTGATGAA----------GCCTTGA----------------------------------- | 18 | 3 |
| | -----------------------------------------------------------------------------------TTCGTTGTTGATGAA----------GCCTT------------------------------------- | 20 | 2 |
| | -----------------------------------------------------------------------------------TTCGTTGTTGATGAA----------GCCTTGAT---------------------------------- | 23 | 2 |
| cel-miR-76 | -----------------------------------------------------------------------------------TTCGTTGTTGATGAA----------GCCTTGA----------------------------------- | 22 | - |
| celegans | ATTTCAGCT--------------CCTGTCTGGGCTTCACAATAGTCGAATACCTTAAATTTCAAA---------ATTTGGATATTCGTTGTTGATGAA----------GCCTTGATGGGGGTGAGAAAGA-------------------- | |
| cbriggsae | -----------ATCCCTCATTCGCCAATTAGGACTTCACAACATGCGAATACCACCACTTCTATG--------------GATATTCGTTGTTGATGAA----------GTCTTAATGGACGTCTGCGGGGTCCAGG-------------- | |
| cjaponica | GTTTTAAATTC------------CTAAATTAAATTTAAAAATTTCCAAAAATCGAAAAGTTCAAAAAAAATTTTAGCGAAATTTTCGTTGTTTTTCGATTTTCTGCTTGTTTTTACAGTTATTTTTGAAGTAGAAC-------------- | |
| cbrenneri | -------------GCCCTATCCATCTGTCAGGACTTCACAATAGTCGAATACCGAT------------------AGCAGGATATTCGTTGTTGATGAA----------GTCTTAATGGGTGTTTTGATGGGGT----------------- | |
| ppacificus | -----------------CGTAGAATGATTGGATCTTAACGACTTTCGTAT----------TTAGA---------CGTGAGATACTCGTTGTCTAATCA----------TTCTATA----------------------------------- | |
| cremanei | AGTTTGATCTACTCGCCCGTCCACCTTTTAGGACTTCACGACAATCGAATACC-----TTCCACA---------CACTGGATATTCGTTGTTGATGAA----------GTCTTAATGGGTGTCTTGAATCGGGGACCGTTTTTTTAAACT | |
| | ** * * * * ** ******* * * * | |
| celegans | .((((.((( ((((((.((((((((((((((.((((((((..(((((....) )))))).)))))))))))).)))) )))).)))))))))..)))).. | 1.000 -41.30 |
| cbriggsae | (((((.((..((((.(((((((((((((((((.((((((((((.........)) ).)))))))))))).)))) )))))))))).))..)).)))))..... | 1.000 -42.70 |
| cjaponica | ((((((..((( ..(((.(((...(((((((...(((((((((((((...(((..((((((((...))))))))..))).))))))))))).))...)))))))...))).))).))).)))))) | 0.948 -21.90 |
| cbrenneri | (((((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((... ....)).)))))))))))).)))) ))))).)))))))....)))))))) | 1.000 -42.10 |
| ppacificus | .(((((((((((((((...((((((((.(((.. ....) )).)))....)))))))))))))) )))))). | 0.997 -24.80 |
| cremanei | (((((((...((((.(((((((((((.(((((((((((((((((.((((((.. .((((.. ...)))))))))))))))).)))) ))))))).)))))....))..))))))..))....))))))) | 0.994 -46.50 |