| seed | ---------------------------------------------------------------------------------------------CACUGGU--------------------------------------------------------- | 1 | miR-359 |
| | | | CE1 |
| | --------------------------------------------------------------------------------------------TCACTGGTCTTTCTCTGACG--------------------------------------------- | 20 | 1 |
| cel-miR-359 | --------------------------------------------------------------------------------------------TCACTGGTCTTTCTCTGACGAA------------------------------------------- | 22 | - |
| celegans | ---------AA--TGCTCCTTGAAA-----TT--------TCAATCGTTAGAGTAACACAC-------AGTTACACGACCTCATCAATCGTGTCACTGGTCTTTCTCTGACGAATTGAAGTTCTGGAGACAATTTTGGT--TG-------------- | |
| cbriggsae | ----AAGATAAGTTACAAATCTAGACAAATCT--------TCATCCGTCAGAGCATATCTC-------AGTTACACAACTTCCTAAATAGTGTCACTGGTTATCCTCTGTCGAAATGAAGATGTCAAAAGTAGCTGTTTT----------------- | |
| cjaponica | ------------TTGCGCTG----------CC--------TCAATCATTGGAAAAATTCAC-------AGTAACAAGAGATTCCCAACT-TGCCACTGGTGTTTTTCTGATGAATTGAAGTCAGTGGCAA--------------------------- | |
| cbrenneri | ---------CATTTGTATTCTGAAAAAAAACTCAAATCGTTCGATTGTCAGAGCAATCCTC-------AGTAACACGTACTCATTATTTGTGTCACTGGTTTTCTTCTGACGAATCGAAATGCTCGAGTTCTGGTTTGTTTTGCGAGAAAATGAATG | |
| ppacificus | --------------------------------------------ATGTGAGAGTAGTGCACCACTTTGAATGATGGAAATGTATCA----TGACACTGGTTACCT--CGACAA-------------------------------------------- | |
| cremanei | GCAAAAGACTAATGGCCTCGATAAA-----CT--------TCATTGGTCAGAGCAACACGC-------AGTCACATAAGTTTCTGAAATGTGTCACTGGTTTTCCTCTGACTAATTGAAGATATCGAGTAAATTTTTTTGT---------------- | |
| | * ** * * * * * * * ** ******* * * | |
| celegans | .. ((((((..(((. (( (((((((((((((.((.((.( (((.((((((.........)))))).)))))).)).)))))))).)))))))))).)))).))........ .. | 1.000 -39.40 |
| cbriggsae | (((((.((((((.......((((..((( ((((.((.(((((.(((..(( (((.((((.............)))).))))).))).))))).))..)))))))))))....))))))))))) | 0.999 -33.62 |
| cjaponica | .((((((( .( ((((((((..(((((((...( (((..((((..........)) ))..))))..)))))))..)))).))).)).))))).)). | 1.000 -30.40 |
| cbrenneri | (((((((.(((((((((.(((((....(((((((((((((((((.((...(( (((.(((((...........))))).)))))..)).))))))).))))))).....))).....))))).)))).)).))).))))))) | 0.810 -35.60 |
| ppacificus | .((((((.(((....((((......((((((......))))) ).....))))))))) ).))). | 0.995 -12.90 |
| cremanei | ((((((((...((...(((((((.. (( (((((((((((((.((.((.( (((.(((((...........))))).)))))).)).))))))))))).)))).)))))))...)))))))))) | 0.997 -39.50 |