| seed | ----------------------------------------------------------------------------GGUACGA-------------------------------- | 0 | novel |
| | | |
| cel-miR-243 | ---------------------------------------------------------------------------CGGTACGATCGCG--GCGGGATATC--------------- | 23 |
| celegans | TGTTCACGCATAAGCCTGATATCTCGGTGCGATCGTACCGTATCGCT--------------CACACT-TAGATTACGGTACGATCGCG--GCGGGATATCAGGTACGTGATTGGA | |
| cbriggsae | -------------GCCAGAAT-----CCGCGTTGGCACGTCGTCGAG----------ATTCTACAATAAGGGTCTCGGTACGATCGGAAGGCGCGGCG----------AATGGAC | |
| cbrenneri | --------------------------AGGCGATGGGTCCTAGTCGCCTTGTCAGTCGATCCATCGAT-TGGCTTGAGGTACGACTGGA--GCTTCACC----------A------ | |
| ppacificus | --------------CTCCGTA-----ATCCGATCGTACCCAGCCGCG-------------CCCTGGT-CGGCT--GGGTACGATCGGA--TTACGGTA----------G------ | |
| | ** * * * ** * * * ******* * | |
| | ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ++++++ ++++++++++++++++++++ ++++++++++++++++++++++++++++++ | R08C7.12.1 R08C7.12 R08C7.12 |
| celegans | ...(((((.....(((((((((((((.(((((((((((((((((... ...... ..)).))))))))))))))) .))))))))))))).)))))..... | 1.000 -55.70 |
| cbriggsae | .(((.... (((((((....(((((((((( (((((......)))))))))..)))).))...))))))).. ..))).. | 1.000 -32.50 |
| cbrenneri | .((.((.((.(((.((((((((((((((((((....))))) ))))..))))..)))))))) .)))).)) . | 1.000 -31.60 |
| ppacificus | ..((((( (((((((((((((((((((.( (....)) ))))) ))))))))))))) )))))).. . | 1.000 -51.40 |