| seed | --------------------------------------------------------------------------------CCUUGUU------------------------------- | 0 | miR-354 |
| | | |
| cel-miR-354 | -------------------------------------------------------------------------------ACCTTGTTTGTTGCTGCTCCT------------------ | 21 |
| celegans | CAGAGCCGACTAAGCACCTTGGTGCGGCTGCAGACGGGTATCCGGCTCGACGTTCATACATCACGACTTCTTTCCTTTTACCTTGTTTGTTGCTGCTCCTATTGGTTTTG-------- | |
| cbriggsae | ------CGACTAAGTGCCTTGGTGCGGCTACAGACGGGTATCCGGCTCGATGTTCATACACCGCGAC-TCTTTCCTTTTACCTTGTTTGTTGCTGCTCCTTTTGGTTTTGATTTGTTG | |
| cjaponica | -------------------TGGTGCGGCTTCGAACGGGTA-ACAGCTCGTCGTTCATAC---------TTCTTCCTTTTACCTTGTTTGTTGCCTCTCCT------------------ | |
| | ********** * ******* * ***** ******** * ********************** ***** | |
| | >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> >>>>> | Y105E8A.16.1 Y105E8A.16 rps-20 |
| | >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> >>>>> | Y105E8A.16.2 Y105E8A.16 rps-20 |
| celegans | (((((((((...........((.(((((.(((((((((((...((...((.(((..........))).))...))...)))).))))))).))))).))..))))))))) | 1.000 -33.02 |
| cbriggsae | ((((.(((((((..((.(((((.(((((((((((...((.(((.(((....)))...))). .....))...))))).)))))).))))).))....)))....)))))))) | 0.985 -31.30 |
| cjaponica | .((...(((..(((((((((( (.((......((....)) ......)).)))))).)))))..)))...)). | 0.999 -17.60 |