| seed | -------------------------------------GGAAUGU------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | 0 | miR-1 |
| | | |
| cel-miR-796 | ------------------------------------TGGAATGTAGTTGAGG---TTAGTAA------------------------------------------------------------------------------------------ | 23 |
| celegans | ---------------------ACTCTAATGACAAGCTGGAATGTAGTTGAGG---TTAGTAAAAGCACTATACTTGTTACAAAC-CTTGCCACGTTCC-------------GACTTGTCAAAAGAGT------------------------- | |
| cremanei | TCGTCTTGA-ACTTCCTCGTCTCCTTCGGTTGCCTTTGGAATGTCGGTGAGAGCGTTGGTGAGTACCTCATCCT-----CAACC---------TTTCC-------------GAGTTCGAGAAGCGCCTTTCCGTAGAGGAAGTTGACCTCGA | |
| cbriggsae | -------GCTACACCATCTTCAC------------CTGGAATGT------GC---CTAGTTTGTAGACTATCCTGT---CGAAC-----TCACTTCCA-------------CTTTGGTGGAGCTTCGTGTACAGC----------------- | |
| cbrenneri | ----------AGTTTTTGGTGAATTGCCAGCCAAAACGGAATGTTGCT-CGC---TTAGAAAAATCACGATTTG-----CAAGCACCAGCCACTTTCC-------------GTTTTCTTGCCGCAGTCATTCAGCAAACAACT--------- | |
| cjaponica | -------GCAATGGAAAAGTGACAATAAGGACAAACTGGAATGTGT---GGAATCTACGTACAAATAC-GTCTG-----GGACTGTTTTGCACTTCCA-------------CTTTTGTTC-------------------------------- | |
| ppacificus | TAATTGAGAAAGATAATTATGAT------ATCGCAGTGGAATGTAGTTTGAA----ATGTAAAGGGATGAGCCT-----TCATCAGTTGGCCCTTCCCATGCTACTCTGCTGCGTTGTGATAGTCGTTTTCCGTTG---------------- | |
| | ******* * * * * * | |
| celegans | (((((..(((((((.((((((((.(..(((( ((.(((((((.......))).)))).))) )))..)))))))) ).)))))))..))))) | 1.000 -35.50 |
| cremanei | ..(((...( ((((((((.........((.(((.(((.((((.((((...(((.(((((((((...)))))... ))))) )).)) )))))).))).)))))........))))))))))))..... | 0.955 -38.03 |
| cbriggsae | (((((((...(((((( ((((((.(( (. ..(((((((((......))). ))))) ))))))))) ....)))))))....))))..))) | 1.000 -27.30 |
| cbrenneri | ((((((((.((((((((..((.(((((((((.((.((( .(( ((....((((....)))). .))))...))).)).)))) )))))...)).)))))...))).)))).)))) | 0.999 -29.90 |
| cjaponica | .....................(((((((.(((((.(((. .(((((((((((....))) ))... )))...)))..)))))))) ..))))))) | 0.829 -21.50 |
| ppacificus | ((((.(((((.(((.(((((((. ..(((((..((..(((((..... (((..(((((.(((.... ...))).....)))))..))))))))))..)))))))))))).))).))))).)))) | 0.941 -36.20 |
| celegans | chromosome:X:1798924:1799012:-1 | intergenic ## {SimpF: WRM0634aB01 -1 fosmid,WRM065dB05 -1 fosmid,WRM068aC12 -1 fosmid,WRM0639cA04 -1 fosmid,WRM0619dF11 -1 fosmid,WRM0618dG07 -1 fosmid} ## {MIR: cel-mir-796} |
| cremanei | chromosome:chrUn:116332607:116332730:-1 | Same_strand|Intronic_coding|NM_071930 |
| cbriggsae | chromosome:chrV_random:1354380:1354465:1 | Same_strand|Intronic_coding|NM_062003 ## Same_strand|Boundary_non-coding|NM_069221 |
| cbrenneri | chromosome:chrUn:169086564:169086674:-1 | intergenic |
| cjaponica | chromosome:chrUn:15517346:15517436:1 | Same_strand|Exonic_coding|NM_074729 |
| ppacificus | chromosome:chrUn:98819157:98819277:1 | Same_strand|Intronic_coding|NM_058427 |