| seed | ---------------GAGGUAA--------------------------------------------------------------------- | 1 | novel |
| | | | CE1 |
| cel-miR-794 | --------------TGAGGTAATCATCGTTGTCACT------------------------------------------------------- | 22 | 1 |
| celegans | CTGAGCGTGTCTCTTGAGGTAATCATCGTTGTCACTTCGCAAAGTTGGAA------TTGAAAACGTTGTCTATCTCGAAAGGCTTATCAG- | |
| cremanei | --------------TGAGGTAAT-------------------GGCTGGAAATATCGACGACGAAACGGATTTTTTCGCCATTTTTTTCTCT | |
| cbrenneri | -------------AGGAGGTAAT----------TCTCCGTTTGGCTGTGG------CCGAATGCTCGGGCAAGAGCGGTGAACGTCTTCCT | |
| ppacificus | --------------AGAGGTAACGCTTTTTGATTCTT------GGTGGAA------GCAAGCAAGCAAGTTAGTTCG-------------- | |
| | ******* * ** * ** | |
| celegans | ((((....((((.((((((((..((.((((.(((.(((.((....))))) .))).)))).))..)))))))).))))...)))) | 1.000 -27.10 |
| cremanei | .((((.((( (((.(((((.(((..((......))))).)))))))))))....)))). | 0.999 -15.20 |
| cbrenneri | ((((((...( ((.((((((.....((. ((((....)))).)).)))))).)))...)))))) | 0.929 -25.70 |
| ppacificus | .(((.((((((((((((.((((. ...)))) .)))).))))..)))).))). | 1.000 -13.90 |