| seed | ------------------------------------------------------------------------------UUUGUAU--------------------------------------------- | 3 | lsy-6 |
| | | | CE1 |
| cel-lsy-6 | -----------------------------------------------------------------------------TTTTGTATGAGACGCATTT------------------CG-------------- | 21 | 3 |
| celegans | ---------------------CCATCAAATGCGTCTAGTATCAAAATCATGTA----AAAACTGTAAAA----CAGATTTTGTATGAGACGCATTT------------------CGATGA---------- | |
| cbriggsae | -----------------CCTTCCACAGAATGCGTCCAGTATCAAAATCACA------TCAAAGAGAATACGG-TGGATTTTGTATGAGACGCATTC----------------CGTGGCGGG--------- | |
| cjaponica | GATTAATT------------GCCACTGGATGCGTCGAATAACAAAATCGAGTGTTCTTACTTTGAAGTATAA-CTGATTTTGTATGAGACGCATTC------------------CAGTGGCATTCTGATC | |
| cbrenneri | TATTGCTGTTCAAAAAACTTGCCACAGAATGCGTCGAATATCAAAATCATG------TCAA----AATATGGATAGATTTTGTATGAGACGCATTTCCGTGGCTGCAATGAACGTGGCGGTG-------- | |
| cremanei | TTTTGATT---------TCCGCCACCGACTGCTTCGAATACCAAAATCATGGG----TAATCTACAGTATGC-CAGATTTTGTATGAGACGCATTC----------------AGTGGCGGGAAGACAAGA | |
| | *** *** ** * ** ******* * * ******************** * | |
| celegans | .((((((((((((((.(((.(((((((.(((. ...........) )))))))))))).)))))))))) .)))). | 1.000 -26.90 |
| cbriggsae | (((.((((.(((((((((..(((.(((((((.(( ((...........)) ))))))))))))..))))))))) .)))).))) | 1.000 -36.30 |
| cjaponica | (((((..( (((((((((((((((..((.((((((((.(((.....((((....))))..) ))))))))))))..))))))).) ))))))))...))))) | 0.998 -44.30 |
| cbrenneri | ((((((((((((........(((((.(((((((((..(((.(((((((.(( ((.. ......))))))))))))))..)))))))))..))))).....)))))..))))))) | 0.995 -41.62 |
| cremanei | (((((.(( ((((((((.((.(((.((..(((.(((((((...(( ((..........))) ).))))))))))..)).))).)) .))))))))))..))))) | 1.000 -38.20 |
| celegans | chromosome:V:10647206:10647278:1 | intergenic ## {SimpF: WRM061cD11 1 fosmid,WRM0635bF11 1 fosmid,WRM0628bA07 1 fosmid} ## {MIR: cel-lsy-6} |
| cbriggsae | chromosome:chrV:7813062:7813142:-1 | Same_strand|Intronic_coding|NM_073462 ## Opposite_strand|Intronic_coding|NM_070877 ## {MIR: cbr-lsy-6} |
| cjaponica | chromosome:chrUn:8397009:8397107:1 | Opposite_strand|Intronic_coding|NM_022073 |
| cbrenneri | chromosome:chrUn:66936444:66936555:1 | intergenic |
| cremanei | chromosome:chrUn:57701747:57701846:1 | Same_strand|Intronic_coding|NM_001114256 |