| seed | -------------------------------------------------------------------------------AAGUGAA---------------------------------------------- | 4 | miR-785/86 |
| | | | CE1 |
| | ------------------------------------------------------------------------------TAAGTGAATTGTTTTGTGTAG--------------------------------- | 21 | 3 |
| | ------------------------------------------------------------------------------TAAGTGAATTGTTTTGTGT----------------------------------- | 19 | 1 |
| cel-miR-785 | ------------------------------------------------------------------------------TAAGTGAATTGTTTTGTGTAGA-------------------------------- | 22 | - |
| celegans | ------------GCTCTTTTTCTCACCCATCAGCACAGAATTTTTCG-CTAACAGAAACCTC---AAAACA----ATGTAAGTGAATTGTTTTGTGTAGATGGTGGAAATG----AGC-------------- | |
| cbriggsae | TTGAAATGCGTTGCTC--TTTCGCAACCGTCAGCACAGAGTGCTTCGACTTACACAGAATTCGTAAAACCAACTGATGTAAGTGAA-TACTCTGTGTTGATGGTGATGATGCTGAAACGTAATGTATTCTAG | |
| cjaponica | ------------GCTCTCTTTT-----CACTAACCCAGAACAACTCG-CTAACACGAACACTGAGAAA-----TGATGTAAGTGAA-TGTTCTGTGTTGGTGGAGATGATG----AGT-------------- | |
| cbrenneri | ------------GCTC-TTTTCTCTCCCGTTAGCACAAAATATTTTA-CTTACACATAAC-----AAAACATATGATGTAAGTGAA-TACTTTGTGTTAATGGAAAAAGGGC-------------------- | |
| ppacificus | ACTGTTGGAAGTGCTC-----------AATAAACTGAAAC--------CTGGCATGAAC------AATTCA--------AAGTGAATCGCTTCCAGCAGA-------------------------------- | |
| cremanei | -------AAACCGCTC--TTTTTTGTCCGTCAGCGCAGAATTTTTTCGCTTACACGAGT------AATGTAAACGATGTAAGTGAA-TATTCTGTGTCGATGGGTATAAAAAGATAATGATGGTTT------ | |
| | **** * * * * ** ** ** ******* * * | |
| celegans | ((((..((((.((((.(((.(((((((((..(((( ((.(((........ ...... .))).))))))..))))))))).))))))))))).) ))) | 1.000 -36.26 |
| cbriggsae | ....((((((((((.. ((((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((...............))).)))))))))) ))))))))))))))))).....))).)))).)))))))))).... | 1.000 -52.06 |
| cjaponica | (((((((((( (((((((.(((((((..((( ((.(((.............. ...))).))))). ))))))).))))))))))).)).) ))) | 0.949 -32.33 |
| cbrenneri | (((( ((((.....(((((((((((((.((.(((( ((((((((((.. ......)))).)))))))))) )).))))))))))))).)))))))) | 1.000 -35.20 |
| ppacificus | .((((((((((((.(( (......((((.. .((.......) ).)))) ...)))..)))))))))))). | 0.543 -20.80 |
| cremanei | ((((((.(( (((((..((((((.(((((((((...((((((((((((... ........)).)))))))))) .))))))))).))))))...)))))))......)))))) | 0.999 -39.50 |
| celegans | chromosome:X:3004660:3004753:1 | intergenic ## {MIR: cel-mir-785} |
| cbriggsae | chromosome:chrX:7891054:7891182:1 | Same_strand|Intronic_coding|NM_178660 ## Opposite_strand|Intronic_coding|NM_133381 ## {MIR: cbr-mir-785} |
| cjaponica | chromosome:chrUn:20283862:20283951:-1 | intergenic |
| cbrenneri | chromosome:chrUn:1355192:1355283:1 | intergenic |
| ppacificus | chromosome:chrUn:73925300:73925433:1 | intergenic ## {Repeats: AT_rich 1 47 1 class=Low_complexity} |
| cremanei | chromosome:chrUn:4287759:4287868:-1 | intergenic |