seed | --------------------------------------------------------------------------------GGCAAGA----------------------------------------------- | 100 | miR-73/74 |
seed | ------------------------------------------------------------------------------------AGAUGUU------------------------------------------- | 3 | novel |
seed | -------------------------------------------------------------------------------UGGCAAG------------------------------------------------ | 1 | novel |
| | | AF16 |
| -------------------------------------------------------------------------------TGGCAAGATGTTGGCAGTCGCAT-------------------------------- | 23 | 69 |
| -------------------------------------------------------------------------------TGGCAAGATGTTGGCAGTCGC---------------------------------- | 21 | 31 |
| -----------------------------------------------------------------------------------AAGATGTTGGCAGTCGCAT-------------------------------- | 19 | 3 |
| ------------------------------------------------------------------------------CTGGCAAGATGTTGGCAGTCGC---------------------------------- | 22 | 1 |
cbriggsae | --------------CGTCCCAAAATTCCGATCCGGCTTCCACATCGAGCCTCAGCT------A--GATCCATAACTTGCTGGCAAGATGTTGGCAGTCGCATTGGATA---AAGGAGAC--------------- | |
cremanei | ------CAGCGAGAGGTCCCTCAA--ACGACTGAGCTTCCACGTCAAGCCTCAGCT------ATCGAATGAAAAATTGCTGGCAAGATGTAGGCAGTTCAGTTGTATG----CGGAGACCAATTTCCTG----- | |
celegans | TTATTCCAGTGAG-AGTCCCACAC--ACGACTGGACTTCCATATCGAGCCACAGCT------ATCAA---CGAATTTGCTGGCAAGATGTAGGCAGTTCAGTTGTGCGTTTATGGAGACCAACATCCGGATTAA | |
cbrenneri | --------------------------GCGATTGGGCTTCCAAGTCTA--CCCAGCA------CTTAA---AAAAGTGGCTGGCAAGACTATGGCAGTCCACTTGC----------------------------- | |
cjaponica | ------GTGTGAGCGGTCCATCGA--GCGACCGAACTTCCATATCGAGCC-CAGCCCACTCGACCAA---ATAAGACGCTGGCAAGATGTTGGCAGTTCAGTCGCAAG---ATTGTGACCAATACTTGCTCCAC | |
| *** ****** ** * * **** * ** ********** ****** * * | |
| +++++ ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ + +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ++++++++ +++++ | NM_059625 |
cbriggsae | .(((((.....((((((.(((((.(((((((..(((..(((. ( (........)).))))))..))))).)).))))).)))))).. ..)).))) | 1.000 -35.10 |
cremanei | (((.((((((((((.((. (((((((((((.(((((((..(((..(((. ...............))))))..))))).)).))))))))))).)) .)).))))..))))))) | 0.999 -45.19 |
celegans | .((.(((.(((.. .(((((((.( (((((((((((.(((((((..(((..(((. ..... .......))))))..))))).)).)))))))))))).))....)).)))...)))..))).)). | 0.990 -41.92 |
cbrenneri | ((((.((((((.((((((((. .(((((( (((.. ..))))).))))..))))).))).)))))).)))) | 1.000 -32.90 |
cjaponica | (((.((((((((((((.. (((((.(((((.(((((((..((. ((((....((...... ....)).))))))..))))).)).))))).)))))..) ).)).)))).......))))))) | 0.997 -44.31 |